1933-1966 yılları arası sadece ortaokul olarak hizmet vermiş, 1964 ve 1966 yıllarında ek binalar inşa edilmiş ve lise bölümü açılmıştır.  İlk mezunlarını 1969 yılında vermiştir. 1933 yılında ortokul ile 1966 yılında lise ile ilgili o yıllara ait tüm arşiv de hali hazırda okulumuzda bulunmaktadır. 1992 yılında zorunlu eğitimin 8 yıla çıkması sebebiyle ortaokul kısmı Zübeyde Hanım İlkokuluna devredilmiş, aynı binalarda Bergama Lisesi eğitim öğretime devam etmiştir. Fakat daha sonra dönemin yöneticileri tarafından okulun şehir merkezinde kalması, binalarda fiziki şartların yetersiz olduğu düşüncesiyle Bayatlı Sitesi’nin üst kısmında yapılan yeni binasına 1996 yılında taşınmıştır.

   Ne yazık ki 2005 yılında İzmir–Seferihisar depreminde okul binası ağır hasar görmüş, hazırlanan rapor sonucu bina boşaltılmıştır.  7 Kasım 2005 Tarihinden itibaren okul eski Bergama Sümerbank Tekstil Fabrikası’nın idari binasında geçici olarak eğitim öğretime devam etmiştir. Mevcut binanın onarım ve güçlendirme çalışmaları tamamlandıktan sonra 2007-2008 öğretim yılı başından itibaren tekrar kendi binasında eğitim öğretime devam etmiştir.

2009-2010 Öğretim yılında Milli Eğitim Bakanlığı 22.06.2010 tarih ve 315/40648 sayılı olur kararı ile kul “Anadolu Lisesine” dönüştürülmüş ve okulun adı  “14 Eylül Bergama Anadolu Lisesi” olarak değiştirilmiştir. 2010-2011 Öğretim yılı itibariyle sınavla öğrenci almaya başlamıştır.

Okul, 1966 yılından 2011 yılına kadar genel lise olarak, 2011 yılından sonra ise Anadolu Lisesi olarak hizmet vermektedir.